Прежнее название Таганского районного суда г. Москвы – Ждановский районный народный суд г. Москвы, который располагался в здании ныне действующего суда по адресу: г. Москва, Марксистский пер., д. 1/32.
В 1989 году Ждановский районный народный суд г. Москвы был переименован в Таганский районный народный суд г. Москвы.
Распоряжением мэра г. Москвы № 30-РМ от 25.01.1994 года Таганский районный народный суд г. Москвы переименован в Таганский межмуниципальный (районный) суд Центрального административного округа города Москвы.
В июле 2003 года в соответствии с федеральным законом № 88-ФЗ Таганский межмуниципальный (районный) суд ЦАО г. Москвы упразднен и создан Таганский районный суд г. Москвы.
С 1997 г. по 2007 г. исполняющим обязанности председателя Таганского районного суда г. Москвы, а затем председателем суда был Дмитриев Алексей Николаевич, который в настоящее время является заместителем председателя Московского городского суда.
С 2009 г. по настоящее время председателем Таганского районного суда г. Москвы является Панарин Михаил Михайлович, до этого работавший судьей Московского городского суда, являвшийся челном судебной коллегии по гражданским делам, а впоследствии председателем состава судебной коллегии по гражданским делам Московского городского суда.
Штат Таганского районного суда состоит из 13 федеральных судей. В 2003 г. в Таганском районе создано пять судебных участков мировых судей.