Муезерский районный суд Республики Карелия был образован на основании Указа Президиума Верховного Совета Карельской АССР от 27 января 1967 года «Об образовании районных народных судов в Калевальском, Муезерском, Пряжинском и Питкяранском районах», приказом № 9 председателя Верховного суда КАССР от 01 февраля 1967 года образовалось ряд новых районных народных судов, в том числе и Муезерский.