Удерейский народный суд был образован в 1926 году и находился в поселке Южно-Енисейске.
В 1955 году, ввиду перевода райцентра в поселок Мотыгино, туда же был переведен и народный суд. Удерейский район был переименован в Мотыгинский, соответственно суд был переименован в Мотыгинский.

Первым судьей Удерейского (ныне Мотыгинского) районного суда был Кордос Георгий Александрович.
Со времени образования суда в должности судей работали: Кордос Г.А., Поздняков А.Г., Князев Н.А., Матэус Л.М., Павлова М.А..
Председателями Мотыгинского районного суда в разные периоды времени являлись: Гора И.М., Орешкова О.Р., Крюков Н.П., Лобкова С.М., Шалаев А.В..

В настоящее время судьями Мотыгинского районного суда являются: Кожокарь Таисья Александровна и Петушкова Ольга Юрьевна.
В настоящее время председателем суда является Моор Юрий Эдуардович.
В результате пожара, произошедшего 29 декабря 2009 года, здание Мотыгинского районного суда Красноярского края было полностью уничтожено, в связи с чем изложить более подробно историю суда не представляется возможным.